Факультет среднего профессионального образования – самый молодой и востребованный факультет университета, дает образование по 10 аккредитованным специальностям. Особенность обучения по программам СПО в Новосибирском государственном аграрном университете — принцип непрерывного профессионального образования и максимальная вовлеченность в процесс работодателей-партнеров. Обучение проводится с использованием современного оборудования, инновационных технологий на базе университета и предприятий-партнеров. Учебные программы предусматривают большое количество практических занятий на предприятиях работодателей-партнеров.